Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMF1P82094 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMF1P82094 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMF1P82094 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMF1P82094 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMF1P82094 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMF1P82094 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMF1P82094 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMF1P82094 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMF1P82094 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMF1P82094 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
TMF1P82094 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMF1P82094 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMF1P82094 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMF1P82094 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMF1P82094 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMF1P82094 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMF1P82094 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMF1P82094 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMF1P82094 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMF1P82094 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMF1P82094 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMF1P82094 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMF1P82094 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMF1P82094 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMF1P82094 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMF1P82094 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TMF1P82094 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMF1P82094 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMF1P82094 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMF1P82094 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMF1P82094 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMF1P82094 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TMF1P82094 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMF1P82094 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMF1P82094 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMF1P82094 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMF1P82094 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMF1P82094 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMF1P82094 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms