Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS25P62851 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS25P62851 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS25P62851 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS25P62851 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS25P62851 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS25P62851 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS25P62851 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS25P62851 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPS25P62851 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPS25P62851 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPS25P62851 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS25P62851 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS25P62851 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS25P62851 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms