Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSM3P62310 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSM3P62310 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSM3P62310 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSM3P62310 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSM3P62310 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSM3P62310 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LSM3P62310 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSM3P62310 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSM3P62310 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSM3P62310 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSM3P62310 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSM3P62310 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms