Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VBP1P61758 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VBP1P61758 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VBP1P61758 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VBP1P61758 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms