Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms