Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTR1AP61163 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms