Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms