Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms