Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2BFSP57053 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms