Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP1P56182 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP1P56182 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP1P56182 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP1P56182 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP1P56182 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP1P56182 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP1P56182 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP1P56182 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP1P56182 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP1P56182 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP1P56182 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP1P56182 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP1P56182 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP1P56182 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP1P56182 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP1P56182 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP1P56182 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP1P56182 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP1P56182 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP1P56182 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP1P56182 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP1P56182 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP1P56182 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP1P56182 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP1P56182 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms