Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO3P55854 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO3P55854 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms