Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFDNP55196 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFDNP55196 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFDNP55196 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
AFDNP55196 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
AFDNP55196 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFDNP55196 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFDNP55196 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFDNP55196 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
AFDNP55196 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFDNP55196 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFDNP55196 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFDNP55196 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms