Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms