Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMTNP53814 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMTNP53814 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMTNP53814 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMTNP53814 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMTNP53814 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms