Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A1P52655 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms