Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCNKBP51801 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms