Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP11P51784 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP11P51784 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP11P51784 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP11P51784 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP11P51784 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP11P51784 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP11P51784 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP11P51784 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP11P51784 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP11P51784 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP11P51784 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms