Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
MTHFSP49914 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTHFSP49914 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTHFSP49914 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTHFSP49914 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFSP49914 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFSP49914 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFSP49914 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFSP49914 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFSP49914 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTHFSP49914 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTHFSP49914 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFSP49914 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MTHFSP49914 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFSP49914 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFSP49914 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFSP49914 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFSP49914 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFSP49914 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFSP49914 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFSP49914 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTHFSP49914 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MTHFSP49914 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTHFSP49914 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms