Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMAN1P49257 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms