Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CX3CR1P49238 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CX3CR1P49238 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms