Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX1P48742 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX1P48742 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX1P48742 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX1P48742 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX1P48742 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX1P48742 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX1P48742 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX1P48742 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX1P48742 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX1P48742 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX1P48742 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX1P48742 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX1P48742 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX1P48742 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX1P48742 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX1P48742 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms