Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ME1P48163 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ME1P48163 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME1P48163 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME1P48163 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME1P48163 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME1P48163 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME1P48163 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME1P48163 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms