Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP2P46087 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP2P46087 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP2P46087 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP2P46087 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP2P46087 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP2P46087 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms