Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A4P43007 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A4P43007 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A4P43007 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A4P43007 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A4P43007 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A4P43007 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A4P43007 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A4P43007 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A4P43007 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A4P43007 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms