Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP2P42575 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP2P42575 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP2P42575 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP2P42575 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP2P42575 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP2P42575 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP2P42575 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP2P42575 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP2P42575 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP2P42575 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP2P42575 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP2P42575 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP2P42575 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms