Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA9P38646 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA9P38646 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms