Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIPAP38571 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIPAP38571 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIPAP38571 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LIPAP38571 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIPAP38571 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms