Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FDFT1P37268 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms