Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJC1P36383 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJC1P36383 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJC1P36383 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJC1P36383 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJC1P36383 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJC1P36383 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJC1P36383 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJC1P36383 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJC1P36383 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJC1P36383 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJC1P36383 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJC1P36383 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJC1P36383 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJC1P36383 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJC1P36383 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms