Protein–RNA interactions for Protein: P34223

SHP1, UBX domain-containing protein 1, yeast

Predictions only

Length 423 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHP1	P34223	ATP7	YKL016C	525 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	BET3	YKR068C	582 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	ARV1	YLR242C	966 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	LSM2	YBL026W	288 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	DGK1	YOR311C	873 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	ALG14	YBR070C	714 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	CWC22	YGR278W	1734 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	FUS1	YCL027W	1539 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	COG3	YER157W	2406 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	TAF2	YCR042C	4224 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	SAP1	YER047C	2694 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	CYR1	YJL005W	6081 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	PSK1	YAL017W	4071 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	YCR081C-A	YCR081C-A	237 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	RPS24A	YER074W	408 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	FYV4	YHR059W	393 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	YJL007C	YJL007C	315 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	RPL20A	YMR242C	519 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	PBI2	YNL015W	228 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	SWM2	YNR004W	441 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	PEP12	YOR036W	867 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	RSA1	YPL193W	1146 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	ARR2	YPR200C	393 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	APC2	YLR127C	2562 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	ASM4	YDL088C	1587 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	TIF35	YDR429C	825 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	YHL006W-A	YHL006W-A	354 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	YAP3	YHL009C	993 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	SYM1	YLR251W	594 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	KEL2	YGR238C	2649 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SHP1	P34223	NPR1	YNL183C	2373 nt		2.59	□□□□□ -2
SHP1	P34223	UBP1	YDL122W	2430 nt		2.59	□□□□□ -2
SHP1	P34223	RPL29	YFR032C-A	180 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	COX13	YGL191W	390 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YHR130C	YHR130C	336 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	SPC1	YJR010C-A	285 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	CTK3	YML112W	891 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	LCL1	YPL056C	306 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YPL205C	YPL205C	345 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	ARP8	YOR141C	2646 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	PFF1	YBR074W	2931 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	SPB1	YCL054W	2526 nt		2.58	□□□□□ -2
SHP1	P34223	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	SOK1	YDR006C	2706 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	BNA7	YDR428C	786 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YER084W-A	YER084W-A	513 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	RAD6	YGL058W	519 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YNL046W	YNL046W	519 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	ESF2	YNR054C	951 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YPR177C	YPR177C	372 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	TRM2	YKR056W	1920 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	PSY2	YNL201C	2577 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		2.57	□□□□□ -2
SHP1	P34223	ESL2	YKR096W	3588 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	SGS1	YMR190C	4344 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	NPR3	YHL023C	3441 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YCR064C	YCR064C	411 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	RTR2	YDR066C	591 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	LCL2	YLR104W	396 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	ISU1	YPL135W	498 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	NSL1	YPL233W	651 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YBR209W	YBR209W	318 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	TOM1	YDR457W	9807 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	ATG11	YPR049C	3537 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	RLF2	YPR018W	1821 nt		2.56	□□□□□ -2
SHP1	P34223	RPS17B	YDR447C	411 nt		2.55	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YFL019C	YFL019C	354 nt		2.55	□□□□□ -2
SHP1	P34223	ERV1	YGR029W	570 nt		2.55	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		2.55	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YLR171W	YLR171W	390 nt		2.55	□□□□□ -2
SHP1	P34223	DDR48	YMR173W	1293 nt		2.55	□□□□□ -2
SHP1	P34223	SKT5	YBL061C	2091 nt		2.55	□□□□□ -2
SHP1	P34223	HSP10	YOR020C	321 nt		2.55	□□□□□ -2
SHP1	P34223	IRC16	YPR038W	360 nt		2.55	□□□□□ -2
SHP1	P34223	POM152	YMR129W	4014 nt		2.55	□□□□□ -2
SHP1	P34223	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.54	□□□□□ -2
SHP1	P34223	ADK1	YDR226W	669 nt		2.54	□□□□□ -2
SHP1	P34223	GPI19	YDR437W	423 nt		2.54	□□□□□ -2
SHP1	P34223	BI2	Q0110	1272 nt		2.54	□□□□□ -2
SHP1	P34223	RTS3	YGR161C	792 nt		2.54	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YJL127C-B	YJL127C-B	159 nt		2.54	□□□□□ -2
SHP1	P34223	TOM22	YNL131W	459 nt		2.54	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YPL080C	YPL080C	327 nt		2.54	□□□□□ -2
SHP1	P34223	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.54	□□□□□ -2
SHP1	P34223	PUF4	YGL014W	2667 nt		2.54	□□□□□ -2
SHP1	P34223	TSA2	YDR453C	591 nt		2.53	□□□□□ -2
SHP1	P34223	HPA3	YEL066W	540 nt		2.53	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YKL202W	YKL202W	582 nt		2.53	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YNL034W	YNL034W	1839 nt		2.53	□□□□□ -2
SHP1	P34223	SRO77	YBL106C	3033 nt		2.53	□□□□□ -2
SHP1	P34223	YER119C-A	YER119C-A	372 nt		2.52	□□□□□ -2.01
SHP1	P34223	RNR4	YGR180C	1038 nt		2.52	□□□□□ -2.01
SHP1	P34223	RPI1	YIL119C	1224 nt		2.52	□□□□□ -2.01
SHP1	P34223	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		2.52	□□□□□ -2.01
SHP1	P34223	PKR1	YMR123W	369 nt		2.52	□□□□□ -2.01
SHP1	P34223	YPL039W	YPL039W	951 nt		2.52	□□□□□ -2.01
SHP1	P34223	RPB5	YBR154C	648 nt		2.52	□□□□□ -2.01
SHP1	P34223	UTP13	YLR222C	2454 nt		2.52	□□□□□ -2.01

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