Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND3P30281 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND3P30281 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND3P30281 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND3P30281 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND3P30281 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND3P30281 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND3P30281 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND3P30281 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND3P30281 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND3P30281 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND3P30281 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND3P30281 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND3P30281 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND3P30281 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms