Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALDH4A1P30038 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms