Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTKP29376 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTKP29376 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LTKP29376 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTKP29376 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTKP29376 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTKP29376 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTKP29376 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTKP29376 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTKP29376 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTKP29376 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTKP29376 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTKP29376 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTKP29376 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTKP29376 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTKP29376 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTKP29376 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTKP29376 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTKP29376 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTKP29376 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LTKP29376 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTKP29376 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTKP29376 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTKP29376 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTKP29376 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTKP29376 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTKP29376 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTKP29376 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTKP29376 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTKP29376 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTKP29376 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTKP29376 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTKP29376 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTKP29376 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTKP29376 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTKP29376 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTKP29376 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms