Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX1P27695 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX1P27695 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX1P27695 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX1P27695 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX1P27695 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX1P27695 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX1P27695 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX1P27695 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX1P27695 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX1P27695 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX1P27695 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX1P27695 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX1P27695 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX1P27695 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms