Protein–RNA interactions for Protein: P27344

DPB3, DNA polymerase epsilon subunit C, yeastyeast

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB3P27344 YLR458WYLR458W 381 nt2.81□□□□□ -1.96
DPB3P27344 UBX4YMR067C 1251 nt2.81□□□□□ -1.96
DPB3P27344 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.81□□□□□ -1.96
DPB3P27344 AYT1YLL063C 1425 nt2.81□□□□□ -1.96
DPB3P27344 LEU3YLR451W 2661 nt2.81□□□□□ -1.96
DPB3P27344 ORC1YML065W 2745 nt2.81□□□□□ -1.96
DPB3P27344 UBR1YGR184C 5853 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 TRA1YHR099W 11235 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 KEL2YGR238C 2649 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 DPB11YJL090C 2295 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 YDR090CYDR090C 933 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 ATX2YOR079C 942 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 YPL080CYPL080C 327 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 PSD2YGR170W 3417 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 ARP8YOR141C 2646 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 YLR001CYLR001C 2589 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 SAK1YER129W 3429 nt2.8□□□□□ -1.96
DPB3P27344 YEL043WYEL043W 2871 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 YRB1YDR002W 606 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 IST3YIR005W 447 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 ILM1YJR118C 612 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 RAM2YKL019W 951 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 CMS1YLR003C 876 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 MPP6YNR024W 561 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 PDR1YGL013C 3207 nt2.79□□□□□ -1.96
DPB3P27344 PRM8YGL053W 714 nt2.78□□□□□ -1.96
DPB3P27344 GIC1YHR061C 945 nt2.78□□□□□ -1.96
DPB3P27344 SHE2YKL130C 741 nt2.78□□□□□ -1.96
DPB3P27344 BER1YLR412W 825 nt2.78□□□□□ -1.96
DPB3P27344 NAN1YPL126W 2691 nt2.77□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YKR078WYKR078W 1758 nt2.77□□□□□ -1.97
DPB3P27344 RRP12YPL012W 3687 nt2.77□□□□□ -1.97
DPB3P27344 SPO13YHR014W 876 nt2.77□□□□□ -1.97
DPB3P27344 ATP15YPL271W 189 nt2.77□□□□□ -1.97
DPB3P27344 NUP100YKL068W 2880 nt2.77□□□□□ -1.97
DPB3P27344 HAA1YPR008W 2085 nt2.77□□□□□ -1.97
DPB3P27344 SNU114YKL173W 3027 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YHR078WYHR078W 1659 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 ESC1YMR219W 4977 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 IRC4YDR540C 540 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YFR056CYFR056C 369 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 TIM10YHR005C-A 282 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 AFB1YLR040C 675 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 RPS17AYML024W 411 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 CSI1YMR025W 888 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 LSM7YNL147W 348 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 RPB11YOL005C 363 nt2.76□□□□□ -1.97
DPB3P27344 BRO1YPL084W 2535 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 VPS13YLL040C 9435 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 CRD1YDL142C 852 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 TIM9YEL020W-A 264 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 UTP30YKR060W 825 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 CCW14YLR390W-A 717 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 IGO1YNL157W 507 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 MGR1YCL044C 1254 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 REV1YOR346W 2958 nt2.75□□□□□ -1.97
DPB3P27344 RAV1YJR033C 4074 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 UBP11YKR098C 2154 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 MDM32YOR147W 1869 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 HYP2YEL034W 474 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 RNR4YGR180C 1038 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YKL044WYKL044W 321 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YLR379WYLR379W 375 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 ICY1YMR195W 384 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 URA10YMR271C 684 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YOR105WYOR105W 327 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 TOA1YOR194C 861 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YOR283WYOR283W 693 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YBR071WYBR071W 636 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 GIS1YDR096W 2685 nt2.74□□□□□ -1.97
DPB3P27344 PHO2YDL106C 1680 nt2.73□□□□□ -1.97
DPB3P27344 PHR1YOR386W 1698 nt2.73□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YLR012CYLR012C 300 nt2.73□□□□□ -1.97
DPB3P27344 RPS7BYNL096C 573 nt2.73□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YOR055WYOR055W 435 nt2.73□□□□□ -1.97
DPB3P27344 MLH1YMR167W 2310 nt2.73□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.72□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.72□□□□□ -1.97
DPB3P27344 BET3YKR068C 582 nt2.72□□□□□ -1.97
DPB3P27344 PHO80YOL001W 882 nt2.72□□□□□ -1.97
DPB3P27344 CAT5YOR125C 702 nt2.72□□□□□ -1.97
DPB3P27344 RSA1YPL193W 1146 nt2.72□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YPR097WYPR097W 3222 nt2.72□□□□□ -1.97
DPB3P27344 EDS1YBR033W 2760 nt2.72□□□□□ -1.97
DPB3P27344 SNU56YDR240C 1479 nt2.71□□□□□ -1.97
DPB3P27344 YDR220CYDR220C 294 nt2.71□□□□□ -1.98
DPB3P27344 CIC1YHR052W 1131 nt2.71□□□□□ -1.98
DPB3P27344 YKL066WYKL066W 444 nt2.71□□□□□ -1.98
DPB3P27344 LOA1YPR139C 903 nt2.71□□□□□ -1.98
DPB3P27344 SVL3YPL032C 2478 nt2.71□□□□□ -1.98
DPB3P27344 SPR3YGR059W 1539 nt2.71□□□□□ -1.98
DPB3P27344 SPF1YEL031W 3648 nt2.71□□□□□ -1.98
DPB3P27344 MPH1YIR002C 2982 nt2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.4 ms