Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMO2P25791 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO2P25791 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO2P25791 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO2P25791 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO2P25791 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO2P25791 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO2P25791 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO2P25791 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMO2P25791 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMO2P25791 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMO2P25791 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMO2P25791 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMO2P25791 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms