Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5F1P24539 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms