Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR2F2P24468 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms