Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2P22307 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2P22307 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2P22307 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCP2P22307 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2P22307 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2P22307 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCP2P22307 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCP2P22307 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCP2P22307 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCP2P22307 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCP2P22307 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms