Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYN1P17600 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYN1P17600 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYN1P17600 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYN1P17600 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYN1P17600 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms