Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD1P17405 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms