Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSCAN20P17040 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSCAN20P17040 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms