Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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