Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCFC2P16383 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms