Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB3P14651 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms