Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms