Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF35P13682 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms