Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYL1P12980 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYL1P12980 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYL1P12980 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYL1P12980 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYL1P12980 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYL1P12980 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms