Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD28P10747 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD28P10747 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD28P10747 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD28P10747 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD28P10747 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD28P10747 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD28P10747 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD28P10747 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD28P10747 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD28P10747 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD28P10747 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD28P10747 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms