Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GLI3P10071 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI3P10071 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI3P10071 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI3P10071 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI3P10071 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI3P10071 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI3P10071 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI3P10071 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GLI3P10071 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GLI3P10071 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GLI3P10071 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GLI3P10071 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GLI3P10071 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GLI3P10071 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GLI3P10071 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GLI3P10071 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GLI3P10071 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GLI3P10071 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GLI3P10071 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GLI3P10071 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI3P10071 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI3P10071 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI3P10071 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI3P10071 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI3P10071 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms